Validação de métodos laboratoriais aplicadas a análises com marcadores microssatélites

Autores/as

  • Tiago Oliveira Universidade Estadual da Paraíba
  • Lucia Hoffmann Embrapa Algodão
  • Poliana Alves Universidade Estadual da Paraíba
  • Valeska Lucena Universidade Federal da Paraíba
  • João Silva Filho Embrapa Algodão

Palabras clave:

Genética Vegetal, Microssatélites, Laboratórios biológicos - controle de qualidade

Resumen

A troca de informação sobre biodiversidade e a utilização de recursos genéticos podem ser melhor realizadas se os laboratórios que geram as informações puderem demonstrar que seus resultados são confiáveis através de metodologias adequadas de validação. Para definir critérios que sirvam para demonstrar a confiabilidade de resultados em laboratórios onde são realizadas pesquisas com marcadores de DNA, foram analisados erros associados à quantificação de DNA em gel de agarose e à repetitividade e robustez da reação da polimerase em cadeia (PCR) utilizando primers baseados em marcadores microssatélites (SSR). O erro associado à quantificação de DNA foi menor quando 100 ng foram quantificadas, e aumentou para quantidades de DNA maiores, com a tendência de subestimar sua quantidade. O limite de quantificação, entendido como as menores diferenças de quantidade de DNA que o método detecta, variou expressivamente com pequena variação da quantidade de DNA. A incerteza associada ao PCR foi estimada por sua repetitividade, que mostrou-se sensível à quantidade de DNA da reação. A baixa robustez da PCR quanto à quantidade de DNA demonstra a necessidade prioritária de avaliação deste parâmetro. As considerações feitas podem ser auxiliares para que laboratórios de marcadores moleculares utilizem procedimentos de validação.

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Publicado

2010-05-26

Número

Sección

Fitotecnia